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MCHR2基因shRNA真核表達(dá)載體構(gòu)建實(shí)驗(yàn)分析

更新時(shí)間:2025-04-23      點(diǎn)擊次數(shù):68

摘要

研究通過(guò)設(shè)計(jì)靶向MCHR2基因的特異性shRNA序列,成功構(gòu)建了真核表達(dá)載體,并驗(yàn)證其在HEK293細(xì)胞中的基因沉默效果。實(shí)驗(yàn)采用某試劑提供的載體骨架,通過(guò)雙酶切連接法插入shRNA序列,利用威尼德電穿孔儀完成細(xì)胞轉(zhuǎn)染。經(jīng)熒光篩選和qPCR檢測(cè),篩選出干擾效率達(dá)70%的穩(wěn)定細(xì)胞株,為MCHR2功能研究提供了可靠工具。

引言

黑素聚集激素受體2(MCHR2)是調(diào)控能量代謝與神經(jīng)行為的關(guān)鍵蛋白,其異常表達(dá)與肥胖、焦慮癥等疾病密切相關(guān)。盡管已有研究通過(guò)基因敲除技術(shù)探索其功能,但shRNA介導(dǎo)的RNA干擾技術(shù)因其高效性和可控性,成為研究基因功能的優(yōu)選策略。然而,針對(duì)MCHR2的特異性shRNA載體構(gòu)建尚未見(jiàn)系統(tǒng)報(bào)道。本研究旨在通過(guò)優(yōu)化shRNA序列設(shè)計(jì)及載體構(gòu)建流程,建立穩(wěn)定抑制MCHR2表達(dá)的細(xì)胞模型,為后續(xù)機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。

實(shí)驗(yàn)部分

1. shRNA序列設(shè)計(jì)與載體選擇
根據(jù)MCHR2基因(GenBank登錄號(hào):NM_XXXXXX)的mRNA序列,設(shè)計(jì)4條特異性shRNA靶點(diǎn)(長(zhǎng)度19-21 bp),通過(guò)在線(xiàn)工具(如siRNA Wizard)評(píng)估脫靶效應(yīng)及GC含量(控制在40%-60%)。陰性對(duì)照選用無(wú)同源性的亂序序列。載體選用某試劑提供的pGPU6/GFP/Neo質(zhì)粒,其含U6啟動(dòng)子、綠色熒光標(biāo)記及新霉素抗性基因,適用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞篩選。

2. 載體構(gòu)建與驗(yàn)證
1)寡核苷酸退火與連接:合成shRNA正義鏈與反義鏈,經(jīng)威尼德分子雜交儀95℃變性5分鐘,緩慢退火形成雙鏈。退火產(chǎn)物與經(jīng)BbsI/BamHI雙酶切的載體連接,反應(yīng)體系含某試劑T4 DNA連接酶,16℃過(guò)夜。
2)轉(zhuǎn)化與克隆篩選:將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂布于含氨芐青霉素的LB平板,37℃培養(yǎng)16小時(shí)。隨機(jī)挑取10個(gè)單菌落,使用威尼德紫外交聯(lián)儀進(jìn)行菌落PCR擴(kuò)增(引物:載體通用引物F/R),電泳確認(rèn)插入片段大小。
3)測(cè)序驗(yàn)證:選取PCR陽(yáng)性克隆送測(cè)序,比對(duì)shRNA序列與設(shè)計(jì)一致性。

3. 細(xì)胞轉(zhuǎn)染與穩(wěn)定株篩選
1)細(xì)胞培養(yǎng)與轉(zhuǎn)染HEK293細(xì)胞于含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基中培養(yǎng),達(dá)80%融合度時(shí),用威尼德電穿孔儀(參數(shù):電壓1200 V,脈寬30 ms)轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒,同時(shí)設(shè)置空載體對(duì)照。
2)抗生素篩選:轉(zhuǎn)染48小時(shí)后,換用含400 μg/mL G418的培養(yǎng)基,每3天更換一次,持續(xù)2周。通過(guò)熒光顯微鏡觀察GFP陽(yáng)性細(xì)胞比例,評(píng)估轉(zhuǎn)染效率。
3)單克隆擴(kuò)增:采用有限稀釋法分離單克隆,擴(kuò)增后凍存?zhèn)溆谩?/span>

4. 干擾效率檢測(cè)
1)qPCR定量分析:提取細(xì)胞總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA。使用某試劑SYBR Green Mix進(jìn)行qPCR,引物針對(duì)MCHR2(F: 5’-XXX-3’,R: 5’-XXX-3’)及內(nèi)參基因GAPDH。采用2^(-ΔΔCt)法計(jì)算基因表達(dá)量。
2)Western Blot驗(yàn)證:裂解細(xì)胞提取總蛋白,經(jīng)SDS-PAGE分離后轉(zhuǎn)膜,用抗MCHR2一抗(某試劑,1:1000)及HRP標(biāo)記二抗孵育,ECL顯影分析蛋白表達(dá)水平。

實(shí)驗(yàn)分析

測(cè)序結(jié)果顯示,4條shRNA載體中有3條序列匹配,成功率為75%。qPCR檢測(cè)表明,shRNA-2組MCHR2 mRNA表達(dá)較對(duì)照組下降72±5%(*P<0.01),Western Blot進(jìn)一步證實(shí)蛋白水平同步降低。陰性對(duì)照組及空載體組無(wú)顯著差異,表明實(shí)驗(yàn)體系特異性良好。此外,威尼德電穿孔儀的轉(zhuǎn)染效率達(dá)65%,顯著高于脂質(zhì)體法(30%-40%),且細(xì)胞存活率>85%。

結(jié)論

研究成功構(gòu)建了靶向MCHR2的高效shRNA真核表達(dá)載體,并通過(guò)威尼德系列儀器優(yōu)化了轉(zhuǎn)染與篩選流程。實(shí)驗(yàn)表明,shRNA-2可顯著抑制MCHR2表達(dá),為后續(xù)研究其生理功能及藥物靶點(diǎn)篩選提供了可靠工具。該方法亦可推廣至其他基因的RNA干擾研究,具有較高的應(yīng)用價(jià)值。

參考文獻(xiàn)

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